傅立叶红外光谱仪不能正常工作时，可先启动仪器自诊断功能，检查仪器某些器件工作状况，或者根据仪器的异常现象，参照仪器使用说明书进行排查。
若发现是傅立叶红外光谱仪硬件损坏，应请专业维修工程师来现场处理，若无法查出故障原因，也应及早与维修工程师沟通，及时传递仪器的故障信息。下面为一些常见故障及排査方法：
故障：干涉图能量低，导致信噪比不理想。
可能原因：
1、光路准直未调节好或非智能红外附件位置未调整到正确位置；
2、红外光源已损坏或能量已衰竭；
3、检测器已损坏或MCT检测器无液氮；
4、分束器损坏；
5、各种红外反射镜或红外附件的镜面太脏；
6、光阑孔径太小或信号增益倍数太小；
7、圆光路中有衰减器。
排除方法：
1、启动光路自动准直程序，如果正在使用非智能红外附件，则还需要人工准直；
2、更换红外光源；
3、请维修工程师检查，必要时更换检测器，检测器损坏很有可能是由于受潮引起，因此更换后应注意保持仪器室的干燥，对于MCT检测器可添加液氮再重新检查；
4、请维修工程师检查，必要时更换分束器（分束器损坏很可能是由于受潮引起或更换时碰撞产生裂痕引起，因此更换后应注意保持仪器室的干燥，从傅立叶红外光谱仪上取出或装入时一定要非常小心）；
5、请维修工程师清洗；
6、重新设置光阑孔径或信号增益倍数，使之处于适当值；
7、取下光路中的衰减器。
